HMDD v3.0: una base de datos para asociaciones de microARN-enfermedad respaldadas experimentalmente

Las bases de datos exhaustivas de asociaciones microARN-enfermedad son continuamente demandadas en investigaciones biomédicas. La versión 3.0 recientemente lanzada de la Base de Datos de Enfermedades de MicroARN Humanos (HMDD v3.0) recopila manualmente un número significativo de entradas de asociación miARN-enfermedad de la literatura. En comparación con HMDD v2.0, esta nueva versión contiene el doble de entradas. Además, las asociaciones han sido clasificadas de manera más precisa según el código de evidencia derivado de la literatura, lo que resulta en seis categorías generalizadas (genética, epigenética, objetivo, circulación, tejido y otras) que cubren 20 tipos de códigos de evidencia detallados. Además, hemos agregado nuevas funcionalidades como visualización de redes en la interfaz web. Para ejemplificar la utilidad de la base de datos, comparamos el ancho del espectro de enfermedad de los miARNs (DSW) y el ancho del espectro de miARN de enfermedades humanas (MSW) entre la versión 3.0 y 2.0 de HMDD. HMDD es accesible libremente en http://www.cuilab.cn/hmdd. Con la acumulación de evidencia de asociaciones miARN-enfermedad, la base de datos HMDD seguirá creciendo en el futuro.