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La evidencia actual indica que la metilación de la citosina en el ADN de mamíferos está restringida a ambas cadenas de la secuencia simétrica CpG, aunque ha habido informes esporádicos de que secuencias distintas de CpG también pueden ser metiladas. Hemos utilizado una técnica de etiquetado dual y métodos de secuenciación genómica con bisulfito para investigar los vecinos más cercanos de los residuos de 5-metilcitosina en el ADN de mamíferos. Encontramos que las células madre embrionarias, pero no los tejidos somáticos, tienen una metilación significativa de citosina-5 en CpA y, en menor medida, en CpT. Dado que la expresión de la metiltransferasa de novo Dnmt3a se correlaciona bien con la presencia de metilación no CpG, nos preguntamos si Dnmt3a podría ser responsable de esta modificación. El análisis de la metilación genómica en Drosophila transgénica que expresa Dnmt3a revela que Dnmt3a es predominantemente una metilasa de CpG, pero también es capaz de inducir metilación en CpA y en CpT.
Ramsahoye et al. (Tue,) estudiaron esta cuestión.