WebMolCS: Una Interfaz Basada en la Web para Visualizar Moléculas en Espacios Químicos Tridimensionales

El concepto de espacio químico proporciona un marco conveniente para analizar grandes colecciones de moléculas colocándolas en espacios de propiedades donde las distancias representan similitudes. Aquí informamos sobre webMolCS, un nuevo tipo de interfaz basada en la web que visualiza hasta 5000 moléculas definidas por el usuario en seis espacios químicos tridimensionales (3D) diferentes obtenidos mediante análisis de componentes principales o mapeo de similitud de espacios de propiedades multidimensionales que describen composición (MQN: 42D números cuánticos moleculares, SMIfp: huella dactilar SMILES 34D), formas y farmacóforos (APfp: huella dactilar de pares de átomos 20D, Xfp: huella dactilar de pares de átomos extendida de categoría 55D), y subestructuras (Sfp: huella dactilar de subestructura binaria 1024D, ECfp4: huella dactilar de conectividad extendida 1024D). Cada molécula se muestra como una esfera, y su estructura aparece al pasar el mouse. La esfera está codificada por colores según la similitud con el primer compuesto en la lista, por el rango de la lista, o por un valor definido por el usuario, lo que revela la relación entre cualquier propiedad codificada por estos valores y similitudes estructurales. WebMolCS está disponible gratuitamente en www.gdb.unibe.ch.