Los puntos clave no están disponibles para este artículo en este momento.
RESUMEN: ModLoop es un servidor web para el modelado automatizado de bucles en estructuras proteicas. La entrada son las coordenadas atómicas de la estructura proteica en formato del Protein Data Bank, y la especificación de los residuos inicial y final de uno o más segmentos a ser modelados, que contengan no más de 20 residuos en total. La salida son las coordenadas de los átomos no hidrogenados en los segmentos modelados. Un usuario proporciona la entrada al servidor a través de una interfaz web simple y recibe la salida por correo electrónico. El servidor se basa en la rutina de modelado de bucles en MODELLER que predice las conformaciones de los bucles mediante la satisfacción de restricciones espaciales, sin depender de una base de datos de estructuras proteicas conocidas. Para una respuesta rápida, ModLoop se ejecuta en un clúster de computadoras PC con Linux. DISPONIBILIDAD: El servidor es accesible de forma gratuita para usuarios académicos en http://salilab.org/modloop.
Fiser et al. (Wed,) estudiaron esta cuestión.