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Las quinasas proteicas juegan un papel crucial en la señalización celular y son objetivos importantes de fármacos en varias áreas terapéuticas. La base de datos KLIFS contiene información detallada sobre interacciones estructurales entre quinasas y ligandos, derivada de más de 2900 estructuras de dominios catalíticos de quinasas proteicas humanas y de ratón depositadas en el Protein Data Bank, con el fin de proporcionar información sobre los determinantes estructurales de la unión de quinasas a ligandos y su selectividad. Las estructuras de quinasa se han procesado de manera coherente, analizando sistemáticamente las características estructurales y las huellas moleculares de interacción (IFPs) de un conjunto predefinido de 85 residuos de sitios de unión con ligandos unidos. KLIFS ha sido completamente reconstruido y ampliado (más del 65% más de estructuras) desde su primera publicación como conjunto de datos, incluyendo: nuevos métodos de anotación automatizados para (i) la evaluación de subpockets dirigidos por ligandos y el análisis de (ii) conformaciones DFG y (iii) de hélice αC; protocolos mejorados y automatizados para (iv) la generación de alineamientos de secuencia/estructura, (v) la curaduría de la tipificación de átomos de ligandos y enlaces para un análisis preciso de IFP y (vi) actualizaciones semanales de la base de datos. KLIFS ahora es accesible a través de un sitio web (http://klifs.vu-compmedchem.nl) que proporciona una presentación visual completa de diferentes tipos de datos quimogenómicos químicos, biológicos y estructurales, y permite al usuario acceder, comparar, buscar y descargar los datos de manera fácil.
Kooistra et al. (Jue,) estudiaron esta cuestión.