El Navegador del Genoma UCSC

El Navegador del Genoma de la Universidad de California Santa Cruz (UCSC) es una popular herramienta basada en la web para mostrar rápidamente una porción solicitada de un genoma a cualquier escala, acompañada de una serie de "pistas" de anotación alineadas. Las anotaciones generadas por el Grupo de Bioinformática del Genoma UCSC y colaboradores externos incluyen predicciones de genes, alineaciones de mRNA y etiquetas de secuencia expresada, polimorfismos de nucleótido simple, datos de expresión y regulación, datos de fenotipo y variación, y datos de genómica comparativa de especies múltiples y por pares. Toda la información relevante a una región se presenta en una ventana, facilitando el análisis e interpretación biológica. Las tablas de base de datos subyacentes a las pistas del Navegador del Genoma se pueden ver, descargar y manipular utilizando otra aplicación basada en la web, el Navegador de Tablas UCSC. Los usuarios pueden subir conjuntos de datos personales en una amplia variedad de formatos como pistas de anotación personalizadas en ambos navegadores para fines de investigación o educativos. Esta unidad describe cómo usar el Navegador del Genoma y el Navegador de Tablas para el análisis del genoma, descargar las tablas de base de datos subyacentes, y crear y mostrar pistas de anotación personalizadas.