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Se estudió la comunidad arqueana metanogénica, la producción de metano y el fraccionamiento isotópico del carbono en los sedimentos profundales del lago oligotrófico Stechlin. Dado que la columna de agua de los lagos oligotróficos suele ser oxígica, el CH4 normalmente no se produce en las capas superficiales del sedimento. Sin embargo, se detectaron secuencias del gen del ARNr 16S de las especies acetoclásticas Methanosaeta y de los hidrogenotróficos Methanomicrobiales, y la producción potencial de CH4 (evaluada a 30°C) fue mucho mayor en la superficie (0-5 cm) que en las capas de sedimento más profundas (20-25 cm), aunque solo comenzó después de que se redujera el sulfato. Los números de copias de los genes del ARNr 16S bacteriano también fueron más altos en la superficie que en las capas de sedimento más profundas, pero los de los genes del ARNr 16S arqueano fueron similares. La metanogénesis hidrogenotrófica y acetoclástica contribuyeron equitativamente a la producción de metano, como se cuantificó mediante un análisis integral de δ13C en carbono orgánico, acetato, CO2 y CH4 y mediante la determinación del factor de enriquecimiento isotópico para la conversión de CO2 a CH4. Este valor (≈−78‰) indica que la energía libre de Gibbs de la metanogénesis hidrogenotrófica fue más negativa, lo que implica que las condiciones energéticas in situ fueron más favorables de lo que sugieren las presiones parciales de H2 medidas. El acetato-metilo producido fermentativamente fue aproximadamente un 10% más ligero que el δ13C del carbono orgánico del sedimento, lo que indica un fraccionamiento inusual durante la producción fermentativa de acetato. La homoacetogénesis a partir de CO2 probablemente jugó solo un papel menor porque la diferencia intramolecular entre el δ13C de los grupos carboxilo y metilo del acetato fue solo del orden de 20‰. Una comunidad microbiana notable es capaz de producir metano a partir de materia orgánica en la capa de superficie oxidada de los sedimentos de lagos oligotróficos en los que normalmente no se produce metano, por lo que la relevancia ecológica de este potencial actualmente es incierta.
Conrad et al. (Sun,) estudiaron esta cuestión.