Perfil del mRNA humano circulante en suero y su utilidad para la detección del cáncer oral

PROPÓSITO: El propósito de este estudio es explorar la presencia de biomarcadores de RNA informativos del transcriptoma del suero humano y evaluar el diagnóstico del transcriptoma sérico para la detección de enfermedades. Se seleccionó el carcinoma de células escamosas orales (OSCC) como la enfermedad de prueba de concepto. PACIENTES Y MÉTODOS: Se recolectaron muestras de sangre de pacientes (n = 32) con OSCC primario T1/T2 y pacientes sanos emparejados (n = 35). Se aisló RNA circulante del suero y se amplificó linealmente utilizando la polimerasa T7. Se aplicaron microarrays para perfilar el transcriptoma en suero de 10 pacientes con cáncer y controles. La expresión génica diferencial se analizó combinando las llamadas presentes, pruebas t y estadísticas de cambio porcentual. La reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa (PCR) se utilizó para validar los marcadores de RNA candidatos seleccionados identificados por microarrays. Se explotaron curvas de características operativas del receptor y modelos de clasificación para evaluar el poder diagnóstico de estos marcadores para OSCC. RESULTADOS: Se presentaron los mRNAs circulantes humanos del suero mediante PCR de transcriptasa reversa. El microarray identificó 2,623 +/- 868 sondas asignadas a llamadas presentes en OSCC (n = 10) frente a 1,792 +/- 165 en pacientes sanos (n = 10), lo que indica una mayor complejidad del transcriptoma del suero en pacientes con OSCC (P = .002, prueba de Wilcoxon). Doscientos treinta y cinco RNAs del suero exhibieron un nivel de expresión diferencial significativamente diferente entre los dos grupos (P ≤ 2). Cinco transcritos genéticos relacionados con el cáncer fueron validados de manera consistente mediante PCR cuantitativa en sueros de pacientes con OSCC (n = 32) y controles (n = 35). La mejor combinación de biomarcadores produjo un valor de la curva de características operativas del receptor del 88%, sensibilidad (91%) y especificidad (71%) en la distinción de OSCC. CONCLUSIÓN: La utilidad del diagnóstico del transcriptoma sérico se demuestra con éxito para la detección de OSCC. Este nuevo concepto podría desarrollarse como una herramienta complementaria para el diagnóstico de enfermedades.