Homología secuencial extensa en los extremos 3' de los cuatro ARN del virus del mosaico del pepino

Las secuencias de 270 residuos de los extremos 3' de los cuatro ARN del virus del mosaico del pepino han sido determinadas copiando los ARN poliadenilados in vitro con transcriptasa inversa utilizando d(pT8G) como iniciador y los 2',3'-dideoxinucleósidos 5'-trifosfatos como terminadores específicos de cadena. Las secuencias terminales de los ARN 3 y 4 eran idénticas; esto era de esperar ya que los datos de hibridación han demostrado que la secuencia del ARN 4 estaba presente en el extremo 3' del ARN 3 (Gould y Symons (1978) Eur. J. Biochem. 91, 269-278). Los primeros 138 residuos de los ARN 1 y 2 eran idénticos a los de los ARN 3 y 4, excepto por un residuo en el ARN 1 y tres residuos en el ARN 2. Desde el residuo 139 hasta el 270 desde el extremo 3', los ARN 1 y 2 mostraron, en relación a los ARN 3 y 4, una región no homóloga de 33 residuos, una región homóloga de 40 residuos y una región parcialmente homóloga de 14 residuos que probablemente se extendía hasta aproximadamente el residuo 300. Hubo 11 residuos diferentes entre los ARN 1 y 2.