El consorcio de estudios de asociación genotipo-ambiente (GENEVA): maximizando el conocimiento obtenido a partir de GWAS mediante la colaboración entre estudios de múltiples condiciones

Los estudios de asociación a nivel del genoma (GWAS) han surgido como medios poderosos para identificar loci genéticos relacionados con enfermedades complejas. Sin embargo, el papel del ambiente y su potencial para interactuar con loci clave no ha sido abordado adecuadamente en la mayoría de los GWAS. Las redes de estudios colaborativos que involucran diferentes poblaciones de estudio y múltiples fenotipos proporcionan un enfoque poderoso para enfrentar los desafíos en el análisis y la interpretación compartidos entre estudios. El consorcio Gene, Environment Association Studies (GENEVA) se inició para: identificar variantes genéticas relacionadas con enfermedades complejas; identificar variaciones en las asociaciones gen genotipo-rasgo relacionadas con exposiciones ambientales; y asegurar la rápida compartición de datos a través de la base de datos de Genotipos y Fenotipos. GENEVA consiste en varias instituciones académicas, incluyendo un centro coordinador, dos centros de genotipificación y 14 estudios diseñados de manera independiente sobre varios fenotipos, así como varios Institutos y Centros de los Institutos Nacionales de Salud liderados por el Instituto Nacional de Investigación del Genoma Humano. Los tamaños de efecto detectables mínimos incluyen riesgos relativos que varían de 1.24 a 1.57 y proporciones de varianza explicada que oscilan entre 0.0097 y 0.02. Dado el gran número de participantes en la investigación (N>80,000), una característica importante de GENEVA es la armonización de variables comunes, lo que permite análisis de rasgos adicionales. La información sobre exposiciones ambientales disponible de la mayoría de los estudios también permite probar interacciones gen-ambiente. Facilitado por su considerable infraestructura para promover la colaboración, GENEVA ha establecido un marco unificado para la genotipificación, control de calidad de datos, análisis e interpretación. Al maximizar el conocimiento obtenido a través de GWAS colaborativos que incorporan información sobre exposiciones ambientales, GENEVA tiene como objetivo mejorar nuestra comprensión de la etiología de las enfermedades, identificando potencialmente oportunidades para la intervención.