Distribución espaciotemporal del salmón chum juvenil en la Bahía de Otsuchi, Iwate, Japón, inferida a partir de ADN ambiental

Para comprender la ecología del salmón chum juvenil durante las primeras etapas de vida marina después de su migración río abajo, desarrollamos un método de ADN ambiental (eDNA) basado en PCR cuantitativa específico para el salmón chum e investigamos la distribución espaciotemporal del eDNA en la Bahía de Otsuchi, Iwate, Japón. Experimentos de acuario en interiores demostraron las siguientes características del eDNA del salmón chum: (1) la liberación y degradación del eDNA dependieron del tiempo y de la temperatura del agua, y la abundancia bacteriana podría contribuir a la descomposición del eDNA, (2) la descarga fecal puede no ser la principal fuente de eDNA, y (3) se encontró una fuerte correlación positiva de Pearson entre el número de juveniles y las cantidades de eDNA. Al descubrir una fuerte inhibición de PCR en las muestras de agua de mar de la bahía, optimizamos el protocolo de ensayo de eDNA para muestras de agua de mar naturales al agregar un paso adicional de purificación y modificar la mezcla de PCR. El análisis intensivo de eDNA en la primavera de 2017 y 2018 indicó que los salmones chum juveniles inicialmente habitaron en aguas poco profundas en la zona costera y luego se dispersaron por la bahía desde enero hasta junio. Los datos de eDNA también señalaron que la migración de salmón chum juvenil al océano abierto se suspendió temporalmente en abril, posiblemente asociado con la dinámica de la Corriente de Oyashio, como sugirió una observación previa. Por lo tanto, el método de eDNA nos permite realizar encuestas a gran escala y completas sin afectar a las poblaciones para comprender las dinámicas espaciotemporales del salmón chum juvenil.