ASTROREPOMICS: Una base de datos transcriptómica curada para la biología reproductiva en el espacio

Los vuelos espaciales imponen un estrés fisiológico considerable en los sistemas reproductivos, sin embargo, los datos transcriptómicos relevantes permanecen fragmentados entre repositorios. Para abordar esta necesidad, desarrollamos ASTROREPOMICS, una plataforma basada en la web que integra 17 conjuntos de datos transcriptómicos rigurosamente normalizados y corregidos por lotes que abarcan múltiples especies y tejidos reproductivos. La plataforma soporta análisis reproducibles entre estudios y entre especies a través de metadatos estandarizados y una interfaz de usuario intuitiva. Destacamos su utilidad mediante dos ejemplos de análisis: (1) el semen de ratón irradiado mostró supresión de las vías de empalme de RNA y procesamiento de proteínas junto con la activación de programas asociados a interferón y GPCR; y (2) una evaluación de DEG interseccionados de múltiples especies entre tejido mamario de ratas irradiadas y embriones de peces cebra expuestos a microgravedad descubrió firmas conservadas que implican metabolismo de RNA, señalización de citoquinas y angiogénesis. Al consolidar conjuntos de datos dispersos y ofrecer capacidades analíticas personalizadas, ASTROREPOMICS proporciona un recurso centralizado para la generación de hipótesis y fortalece la infraestructura de investigación necesaria para avanzar en estudios de salud reproductiva en el espacio, apoyando esfuerzos a largo plazo para salvaguardar la fertilidad durante la exploración en el espacio profundo.