Un método novedoso para la predicción de sitios de sumoilación con alta precisión a partir de secuencias de proteínas

ANTECEDENTES: La sumoilación de proteínas es una modificación postraduccional dinámica y reversible esencial que desempeña un papel en docenas de actividades celulares, especialmente en la regulación de la expresión génica y el mantenimiento de la estabilidad genómica. Actualmente, las complejidades del mecanismo de sumoilación no pueden ser resueltas perfectamente por enfoques experimentales. En este sentido, los enfoques computacionales podrían representar un método prometedor para dirigir la identificación experimental de sitios de sumoilación y arrojar luz sobre la comprensión del mecanismo de la reacción. RESULTADOS: Aquí presentamos un método estadístico para la predicción de sitios de sumoilación. Una prueba de validación cruzada de 5 pliegues sobre los sitios de sumoilación identificados experimentalmente arrojó un excelente rendimiento de predicción con un coeficiente de correlación, especificidad, sensibilidad y precisión iguales a 0.6364, 97.67%, 73.96% y 96.71% respectivamente. Además, el rendimiento del predictor se mantiene cuando se eliminan los homólogos de alto nivel. CONCLUSIÓN: Al utilizar un método estadístico, hemos desarrollado un nuevo método de predicción de sitios SUMO - SUMOpre, que ha demostrado su gran precisión con un coeficiente de correlación, especificidad, sensibilidad y precisión.