Comprendiendo la evolución divergente y la epidemiología de los virus de la influenza H3N8 en perros y caballos

Los eventos de transmisión de virus entre especies pueden llevar a graves emergencias de salud pública en forma de epidemias y pandemias. Un ejemplo en animales es la aparición del virus de la influenza equina H3N8 (EIV), aislado por primera vez en 1963 en Miami, FL, EE. UU., tras surgir entre caballos en América del Sur. A principios del siglo XXI, la línea americana de EIV se dividió en dos clados 'Florida' que persisten hoy, mientras que un EIV se transfirió a los perros alrededor de 1999 y dio origen al virus de la influenza canina H3N8 (CIV), reportado por primera vez en 2004. Aquí, comparamos el CIV en perros y el EIV en caballos para revelar su evolución específica del huésped, determinar las fuentes y conexiones entre brotes significativos, y obtener información sobre los factores que controlan sus diferentes destinos evolutivos. El H3N8 CIV solo circuló en América del Norte, estuvo geográficamente restringido después de los primeros años y se extinguió en 2016. De los dos clados de EIV de Florida, el clado 1 circula ampliamente y muestra transferencias frecuentes entre EE. UU. y América del Sur, Europa y otros lugares, mientras que el clado 2 se distribuyó globalmente poco después de su aparición, pero desde alrededor de 2018 solo ha sido detectado en Asia Central. Cualquier posible amenaza zoonótica de estos virus para los humanos solo puede determinarse con un entendimiento de su historia natural y evolución. Nuestro análisis comparativo de estas tres linajes virales revela patrones y tasas de variación de secuencia distintos, pero con una evolución general similar entre clados, lo que sugiere estrategias de intervención epidemiológica para la posible erradicación del EIV H3N8.