La ocupación dinámica de EBF1 dirige eventos epigenéticos y transcripcionales secuenciales en la programación de células B

La determinación del destino de las células B requiere la acción de factores de transcripción que operan en una red reguladora para activar genes de linaje B y reprimir genes inapropiados para el linaje. Sin embargo, la dinámica y jerarquía de los eventos en la programación de células B siguen siendo oscuras. Para desacoplar la dinámica de la expresión de factores de transcripción de las consecuencias funcionales, generamos sistemas de inducción en células pre-pro-B Ebf1 −/− arrestadas en desarrollo para permitir un control experimental preciso de la expresión de EBF1 en el contexto genómico de las células progenitoras. Consistente con el papel descrito de EBF1 como un factor de transcripción pionero, mostramos en un análisis temporal que la ocupación de EBF1 coincide con la expresión de EBF1 y precede a la formación de accesibilidad cromatínica. Observamos patrones dinámicos de expresión de genes objetivo de EBF1 y una regulación ascendente secuencial de factores de transcripción que expanden la red reguladora en la etapa de células pro-B. Se encontró que una función continua de EBF1 era necesaria para la actividad del promotor de Cd79a y para el mantenimiento de un dominio de cromatina accesible que es permisivo para la unión de otros factores de transcripción. Notablemente, se detectó una ocupación transitoria de EBF1 en genes inapropiados para el linaje antes de su silenciamiento en células pro-B. Así, las funciones persistentes y transitorias de EBF1 permiten una secuencia ordenada de eventos epigenéticos y transcripcionales en la programación de células B.