Fusión de la procedencia computacional y experimental en RO-Crate

Resumen Los proyectos de investigación modernos suelen implicar varias técnicas de medición y análisis computacionales, lo que resulta en complejos objetos de datos de investigación multimodales. Si bien los Principios FAIR proporcionan un marco para hacer que los datos sean encontrables, accesibles, interoperables y reutilizables, los investigadores aún deben aplicar estándares de la comunidad para cada tipo de dato, cuando están disponibles. Este desafío es particularmente pronunciado en los análisis y flujos de trabajo computacionales, donde la alta diversidad metodológica dificulta la creación de Objetos Digitales FAIR significativos que también capturen la procedencia experimental. Tales objetos deben describir todo el proceso de investigación interconectando pasos experimentales y computacionales en un modelo de procedencia unificado y consultable. El marco ISA captura protocolos y procesos de laboratorio, mientras que los análisis computacionales se describen utilizando modelos centrados en los flujos de trabajo, como Workflow (Run) RO-Crate, que separan las definiciones del flujo de trabajo de las trazas de ejecución. A pesar de las similitudes conceptuales, estos enfoques siguen estando en gran medida desconectados. Este documento presenta el perfil ARC Workflow Run RO-Crate, que alinea la procedencia experimental basada en ISA con los metadatos de flujos de trabajo y ejecución en un único contenedor conforme a estándares. Permite semánticas compartidas y hace que los ensayos experimentales y las ejecuciones de flujos de trabajo sean interoperables dentro de un gráfico de procedencia coherente interpretable por herramientas tanto conscientes de ISA como de flujos de trabajo. Al mismo tiempo, el perfil armoniza la procedencia experimental y computacional y sigue siendo compatible con los ecosistemas de herramientas existentes de (Workflow) RO-Crate e ISA.