Mapeo de loci de rasgos cuantitativos que controlan la germinabilidad a baja temperatura en arroz (Oryza sativa L.).

Se identificaron loci de rasgos cuantitativos (QTLs) que controlan la germinabilidad a baja temperatura (LTG) en arroz utilizando 98 líneas de retrocruzamiento (BILs) derivadas de un cruce entre una variedad japonica Nipponbare y una variedad indica Kasalath. Las semillas de cada BIL se almacenaron a 30°C en una máquina de secado durante 7 meses para excluir los efectos de la dormancia de las semillas. Luego se evaluó la tasa de germinación a 15°C durante 4 días para representar el LTG. El LTG de Nipponbare y Kasalath fue del 17% y 61%, respectivamente, y el de los BILs osciló entre 0% y 100%. Se detectaron cinco QTLs putativos, qLTG-2, qLTG-4-1, qLTG-4-2, qLTG-5 y qLTG-11, en el cromosoma 2 (G1327: locus de marcador más cercano), 4 (dos regiones, C946 y C513), 5 (R830) y el cromosoma 11 (G1465). En el caso de qLTG-2, qLTG-4-1 y qLTG-11, los alelos de Kasalath aumentaron el LTG, mientras que los alelos de Nipponbare lo aumentaron en el caso de qLTG-4-2 y qLTG-5. Estos QTLs explicaron el 40.7% de la variación fenotípica total en las líneas BC1F9. Utilizando líneas de sustitución de segmentos cromosómicos (SLs), se confirmó la existencia de qLTG-4-1 y qLTG-11 y el efecto del alelo de Kasalath en qLTG-11 fue más pronunciado que el de qLTG-4-1. El efecto del alelo de Kasalath en qLTG-4-2, que suprimió la germinación, fue temporal y desapareció después de 7 a 8 meses de almacenamiento, lo que sugiere que la desaparición se debió a la ruptura de la dormancia de la semilla y que qLTG-4-2 podría controlarla. El alelo de Kasalath en el caso de qLTG-5 disminuyó la tasa de germinación cuando el efecto de la dormancia fue completamente eliminado. Por lo tanto, concluimos que qLTG-5 estaba involucrado en LTG pero no en la dormancia de la semilla.