Perfil proteómico de proteínas de superficie en células Th1 y Th2

Utilizamos espectrometría de masas para perfilar la expresión diferencial de proteínas de superficie celular en células T helpers (Th1 y Th2) humanas primarias utilizando el enfoque de etiquetado con isótopos estables por aminoácidos en cultivo celular (SILAC). Se realizaron análisis proteómicos y de microarray de manera concurrente y se compararon resultados para 38 genes diferentes. Aunque los estudios de microarray mostraron una amplia variabilidad entre donantes para la expresión de ARN mensajero (ARNm), estos dos enfoques se mostraron corroborativos para la mayoría de los productos génicos, excepto para un pequeño subconjunto de niveles de proteínas y mensajes no correlacionados. Las mayores diferencias en las proporciones de Th1 a Th2 se observaron para BST2 (proteína estromal de médula ósea 2) y TRIM (molécula que interactúa con el receptor de células T). Ambos mostraron una mayor expresión de Th1 mediante métodos proteómicos, a pesar de que los niveles de ARNm eran aproximadamente iguales para ambos. Para validar este método, comparamos los niveles de expresión de proteínas de una molécula recién clonada, atenuador de linfocitos B y T (BTLA), en poblaciones de células Th1 y Th2 y mostramos una mayor expresión de proteínas en células Th1, lo que concuerda con un análisis previo de mayor expresión de ARNm de BTLA en células Th1.(1).