ब्रोइलर आंत माइक्रोबायोम के कार्यात्मक संभावनाओं की खोज शॉटगन मेटाजेनोमिक्स का उपयोग करते हुए

पृष्ठभूमि/उद्देश्य: एंटीमाइक्रोबियल पेप्टाइड्स (एएमपी) ने पशुधन में पारंपरिक एंटीबायोटिक्स का एक संभावित विकल्प प्रदान किया है, जो खाद्य उत्पादन प्रणालियों में बैक्टीरिया के रोगकारकों को नियंत्रित करने के लिए एक स्थायी रणनीति प्रदान करते हैं। उनके प्रत्यक्ष एंटीमाइक्रोबियल प्रभावों के अलावा, एएमपी मेज़बान-संबंधित माइक्रोबायोम को मॉड्यूलेट करने में महत्वपूर्ण भूमिका निभाते हैं, जो सूक्ष्मजीवों की संरचना और कार्य को प्रभावित करते हैं। मेटाजेनोमिक अनुक्रमण और जैवसूचना उपकरणों में प्रगति अब जटिल सूक्ष्मजीव पारिस्थितिकी तंत्र के भीतर एएमपी विविधता और गतिविधि की समग्र खोज की अनुमति देती है। विधियां: इस अध्ययन में, हमने स्पेनिश कट slaughterhouse से ब्रोइलर मुर्गियों के छह आंत खंडों से आंतरिक सामग्री का विश्लेषण करने के लिए इल्यूमिना-आधारित अगली पीढ़ी के अनुक्रमण (NGS) का उपयोग किया। परिणाम: न्यूवो विधानसभा और जैवसूचना एनोटेशन के माध्यम से, हमने राइबोसोमली संश्लेषित और पोस्ट-ट्रांसलेशनल रूप से संशोधित पेप्टाइड्स (RiPPs), अन्य विशिष्ट जैव सक्रिय माध्यमिक उपापचयी, एंटीमाइक्रोबियल प्रतिरोध जीन (ARGs), virulence factor जीन (VFGs) और एक विविध माइक्रोबियल समुदाय के लिए कोडिंग करने वाले बायोसिंथेटिक जीन क्लस्टर (BGCs) को पहचाना। सभी आंत खंडों में, सैकम ने सबसे अधिक आनुवंशिक समृद्धि दिखाई, जो RiPP-सदृश क्लस्टरों और एंटीमाइक्रोबियल प्रतिरोध निर्धारकों की उच्च विविधता द्वारा विशेषता रखती है। निष्कर्ष: ये निष्कर्ष पोल्ट्री आंत, विशेष रूप से सैकम, को एंटीमाइक्रोबियल पेप्टाइड्स (एएमपी) के एक महत्वपूर्ण भंडार के रूप में उजागर करते हैं, जिनके संभावित प्रभाव एंटीबायोटिक-मुक्त पोल्ट्री उत्पादन और बेहतर खाद्य सुरक्षा में हो सकते हैं।