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सिस्प्लेटिन, कैंसर की कीमोथेरेपी में एक प्रतीकात्मक तत्व, अपनी डीएनए-बाइंडिंग क्षमता के लिए जाना जाता है और कैंसर कोशिका मृत्यु की ओर ले जाने वाले घाव बनाता है। हालाँकि, इन घावों की मरम्मत सिस्प्लेटिन की प्रभावशीलता को समझौता करती है। यह अध्ययन जांच करता है कि HMGB1, एक न्यूक्लियर प्रोटीन, के फॉस्फोरिलेशन से सिस्प्लेटिन-संशोधित डीएनए (CP-DNA) के लिए इसके बंधन को कैसे संशोधित किया जाता है और इस प्रकार इसे मरम्मत से बचाता है। प्रोटीन-डीएनए इंटरैक्शन का पता लगाने के लिए कई तरीकों के बावजूद, उनके आणविक तंत्र को समझने के लिए मात्रात्मक दृष्टिकोण सीमित हैं। यहाँ, हमने क्लिक रसायन विज्ञान-आधारित सिंगल-मॉलिक्यूलर फोर्स स्पेक्ट्रोस्कोपी का उपयोग किया, जिससे फॉस्फोरिलेटेड HMGB1 और CP-DNA के बीच इंटरैक्शन की उच्च-सटीकता मापन प्राप्त हुआ। यह विधि प्रणाली में सटीक डीएनए-प्रोटीन इमोबिलाइजेशन और इंटरैक्शन के लिए क्लिक रसायन विज्ञान और एंजाइमेटिक लिगेशन का संयोजन उपयोग करती है। हमारे परिणामों से पता चला कि HMGB1 CP-DNA से ∼130 pN की महत्वपूर्ण उच्च टूटने की शक्ति के साथ बंधता है, जो अधिकांश प्राकृतिक डीएनए-प्रोटीन इंटरैक्शन से अधिक मजबूत है और विभिन्न डीएनए अनुक्रमों में भिन्न है। इसके अलावा, Ser14 को प्रमुख फॉस्फोरिलेशन साइट के रूप में पहचाना गया है, जो इंटरैक्शन की गतिशील स्थिरता को 35 गुना बढ़ाता है। स्थिरता में यह वृद्धि आणविक डायनामिक्स (MD) सिमुलेशन द्वारा सुझाए गए अतिरिक्त हाइड्रोजन बांडिंग के लिए जिम्मेदार है। हमारे निष्कर्ष यह नहीं केवल दिखाते हैं कि फॉस्फोरिलेटेड HMGB1 सिस्प्लेटिन की चिकित्सा दक्षता में संभावित सुधार में महत्वपूर्ण भूमिका निभाता है बल्कि प्रोटीन-डीएनए इंटरैक्शन की मात्रात्मक मापन के लिए एक सटीक विधि भी प्रदान करते हैं।
लियू एट अल। (गुरुवार,) ने इस प्रश्न का अध्ययन किया।