मटर में फ्यूजेरियम विल्ट प्रतिरोधी जीन FwS1 की फाइन मैपिंग और पहचान

सारांश: Fusarium oxysporum f. sp. pisi (Fop) द्वारा उत्पन्न मटर का फ्यूजेरियम विल्ट, हमेशा से एक विनाशकारी रोग रहा है जो दुनिया भर के मटर उगाने वाले क्षेत्रों में भारी उपज हानि और आर्थिक क्षति का कारण बनता है। प्रतिरोधी जीन युक्त मटर की किस्मों का उपयोग इस रोग के प्रबंधन के लिए सबसे प्रभावी तरीका है। प्रतिरोधी जीन की फाइन मैपिंग करने के उद्देश्य से, Shijiadacaiwan 1 (प्रतिरोधी) और Y4 (संवेदनशील) के बीच क्रॉस के माध्यम से एक F2 जनसंख्या स्थापित की गई थी। आनुवंशिक प्रतिरोध विश्लेषण ने संकेत दिया कि Shijiadacaiwan 1 में Fop प्रतिरोध एक एकल प्रभावी जीन द्वारा नियंत्रित था, जिसे FwS1 नाम दिया गया। बल्क्ड सेग्रीगेंट एनालिसिस सीक्वेंसिंग (BSA-seq) विश्लेषणों के आधार पर, FwS1 जीन का शुरू में क्रोमोसोम 6 (अर्थात, लिंकेज समूह Ⅱ, chr6LG2) पर पता चला था, और 589 F2 व्यक्तियों के साथ बाद के लिंकेज मैपिंग ने FwS1 जीन को 91.4 kb क्षेत्र में फाइन-मैप किया। आगे के कार्यात्मक एनोटेशन और हैप्लोटाइप विश्लेषण ने पुष्टि की कि NB-ARC (APAF-1, R प्रोटीनों, और CED-4 द्वारा साझा किया गया न्यूक्लियोटाइड-बाइंडिंग एडाप्टर) डोमेन की विशेषता वाला जीन Psat6g003960 सबसे आशाजनक उम्मीदवार जीन माना गया था। Psat6g003960 के पहले एक्सॉन में "T/C" सिंगल-न्यूक्लियोटाइड पॉलीमॉर्फिज्म (SNP) द्वारा एन्कोडिंग अमीनो एसिड बदल गए थे, जिसके परिणामस्वरूप मटर में Fop प्रतिरोध के देखे गए अंतर उत्पन्न हुए। इस SNP लोकस के आधार पर, विभिन्न आनुवंशिक पृष्ठभूमियों वाले मटर के एक्सेशन और आनुवंशिक आबादी दोनों में इसकी विशिष्टता को मान्य करके आणविक मार्कर A016180 को FwS1 के लिए एक नैदानिक (डायग्नोस्टिक) मार्कर के रूप में निर्धारित किया गया था। डायग्नोस्टिक KASP मार्कर A016180 के साथ FwS1 मटर में प्रतिरोधी मटर प्रजनन में मार्कर-असिस्टेड चयन को सुगम बना सकता है। इसके अतिरिक्त, 74SN3B और SJ1 के उम्मीदवार जीन Psat6g003960 की तुलना करने पर, यह देखा गया कि उनके अनुक्रम समान हैं, जो यह सुझाव देता है कि FwS1 और Fwf फ्यूजेरियम विल्ट के विरुद्ध समान प्रतिरोधी जीन हो सकते हैं।