SPADE: डोमेन विशेष ग्राहक प्रकार अनुमान के लिए स्थानिक डीकन्वोल्यूशन

सार विभिन्न सेल प्रकारों में जीन अभिव्यक्ति को उनके स्थानिक संदर्भ में समझना जीनोमिक्स अनुसंधान में एक प्रमुख लक्ष्य है। SPADE (SPAtial DEconvolution), हमारी प्रस्तावित विधि, सेल प्रकार की संरचना के विश्लेषण में स्थानिक पैटर्न को एकीकृत करके इस लक्ष्य को पूरा करती है। यह दृष्टिकोण एकल-सेल आरएनए अनुक्रमण, स्थानिक ट्रांसक्रिप्टोमिक्स और हिस्टोलॉजिकल डेटा के संयोजन का उपयोग करके विभिन्न स्थानों में सेल प्रकारों के अनुपात को सटीक रूप से अनुमानित करता है। कृत्रिम डेटा के हमारे विश्लेषणों ने SPADE की विशिष्ट स्थानिक पैटर्न को पहचानने की क्षमता को प्रभावी ढंग से प्रदर्शित किया है। जब इसे वास्तविक जीवन के डेटासेट पर लागू किया गया, SPADE कोशिकीय गतिशीलता और ट्यूमर ऊतकों की संरचना में अंतर्दृष्टि प्रदान करता है। यह जटिल जीववैज्ञानिक प्रणालियों की हमारी समझ को बढ़ाता है और कोशिकीय विविधता का पता लगाने में मदद करता है। SPADE स्थानिक जीन अभिव्यक्ति पैटर्न को समझने में एक महत्वपूर्ण उन्नति का प्रतिनिधित्व करता है, जो स्थानिक ट्रांसक्रिप्टोमिक्स में सेल प्रकारों के विस्तृत जांच के लिए एक शक्तिशाली उपकरण प्रदान करता है।