वनिकी की कीट कोरोनाप्रोक्टस कास्टैनोप्सिस का क्रोमोसोम-स्तरीय जीनोम एसेम्बली

सार: एक महत्वपूर्ण वनिकी कीट, कोरोनाप्रोक्टस कास्टैनोप्सिस (मोноफ्लेबिडे) ने चीन के वैश्विक मूल्यवान गुटियानशान पारिस्थितिकी तंत्र को गंभीर क्षति पहुँचाई है। इस अध्ययन में, हमने C. कास्टैनोप्सिस के मादा नमूने का पहला क्रोमोसोम-स्तरीय जीनोम BGI रीड्स, HiFi लॉन्ग रीड्स और Hi-C डेटा का विलयन करके संकलित किया। संकलित जीनोम का आकार 700.81 Mb है, जिसमें एक स्कैफोल्ड N50 आकार 273.84 Mb और एक कंटिग N50 आकार 12.37 Mb है। Hi-C स्कैफोल्डिंग ने C. कास्टैनोप्सिस जीनोम के 98.32% (689.03 Mb) को तीन क्रोमोसोमों में सौंपा। BUSCO विश्लेषण (n = 1,367) ने 91.2% की पूर्णता दिखाई, जिसमें 89.2% एकल-नहीं BUSCOs और 2.0% बहु-प्रतिलिपि BUSCOs शामिल हैं। BGI, दूसरे- पीढ़ी के RNA, तीसरे-पीढ़ी के RNA और HiFi रीड्स का मैपिंग अनुपात क्रमशः 97.84%, 96.15%, 97.96%, और 99.33% है। हमने 64.97% (455.3 Mb) पुनरावृत्त तत्व, 1,373 अन-कोडिंग RNA और 10,542 प्रोटीन-कोडिंग जीन भी पहचाने। इस अध्ययन ने C. कास्टैनोप्सिस का उच्च गुणवत्ता वाला जीनोम संकलित किया, जिसने स्केल कीटों के लिए मूल्यवान आणविक डेटा जमा किया।