चूहों और इंसानों के प्रोटीन-कोडिंग ट्रांसक्रिप्टोम का जीन एटलस

टिश्यू-विशिष्ट mRNA व्यक्तित्व का पैटर्न जीन कार्य के बारे में महत्वपूर्ण सुराग संकेत कर सकता है। ऊँचाई-घनत्व ओलिगोन्यूक्लियोटाइड एरे जीन व्यक्तित्व के पैटर्न की परीक्षा करने का अवसर प्रदान करते हैं। इस लक्ष्य की ओर, हमने कस्टम एरे डिजाइन किए हैं जो प्रोटीन-कोडिंग मानव और चूहों के जीन के विशाल बहुमत के व्यक्तित्व की जांच करते हैं और इन्हें 79 मानव और 61 चूहों के ऊतकों के एक पैनल का प्रोफाइल देने के लिए इस्तेमाल किया है। परिणामी डेटा सेट हजारों पूर्वानुमानित जीनों के लिए व्यक्तित्व पैटर्न प्रदान करता है, साथ ही ज्ञात और कम अच्छी तरह से वर्णित जीनों के लिए, चूहों और मानवों से। हमने जीन व्यक्तित्व में वैश्विक प्रवृत्तियों के लिए इस डेटा सेट की जांच की है, जीन पूर्वानुमान विधियों में सामान्य रूप से उपयोग की जाने वाली साक्ष्य की रेखाओं का मूल्यांकन किया है, और ट्रांसक्रिप्शन की गुणसूत्र संगठना के संकेत देने वाले पैटर्न की जांच की है। हम सहसंबंधित ट्रांसक्रिप्शन के सैकड़ों क्षेत्रों का वर्णन करते हैं और दिखाते हैं कि कुछ ऊतक और माता-पिता एलील-विशिष्ट व्यक्तित्व दोनों के अधीन हैं, जो स्थानिक व्यक्तित्व और इम्प्रिंटिंग के बीच एक लिंक का सुझाव देते हैं।