BPS2026 – कारक V लीडन उत्परिवर्तन में संरचनात्मक परिवर्तनों का कंप्यूटेशनल मॉडलिंग करना रक्त थक्के विकारों को रोकने के लिए

कारक V (FV) रक्त जमने वाला अति महत्वपूर्ण प्रोटीन है जो क्लॉगिंग सिस्टम का हिस्सा है। यह निष्क्रिय रूप रक्त प्रवाह में तब तक घूमता है जब तक इसकी आवश्यकता नहीं होती है, फिर थ्रोम्बिन द्वारा कारक Va (FVa) में सक्रिय होता है, जो प्रोटीन के बाइंडिंग साइट्स को उजागर करता है। FVa को सक्रिय प्रोटीन C और प्रोटीन S (APC:PS) के एक संयोजन द्वारा निष्क्रिय किया जा सकता है, जो FVa को अवशेष R306, R506, और R679 पर काटता है, जिससे जमने की श्रृंखला को रोकता है। आरजिनिन से ग्लूटामीन में एकल अमीनो एसिड उत्परिवर्तन R506 पर कारक V लीडन (FVL) का कारण बनता है, जो APC:PS के FVa से बाइंडिंग को प्रभावित करता है, इस प्रकार असामान्य रक्त थक्कों की संभावना बढ़ती है। इस उत्परिवर्तन का वर्तमान में कोई इलाज नहीं है - केवल एंटीकोआगुलेंट दवाएँ निर्धारित की जाती हैं। हमने इस उत्परिवर्तन का अधिक अध्ययन करने और संभावित रूप से FVL के लिए एक विशिष्ट उपचार विकसित करने के लिए FVa और APC:PS के बाइंडिंग साइट का विश्लेषण किया। हम HADDOCK के साथ आणविक डोकिंग और एम्बर के साथ आणविक डायनामिक्स जैसी कंप्यूटेशनल विधियों का उपयोग करते हैं, हम विभिन्न प्रोटीन-प्रोटीन प्रणालियों के बीच बाइंडिंग इंटरैक्शन का अवलोकन करते हैं। प्रारंभिक परिणाम सुझाव देते हैं कि जंगली प्रकार और प्रतिनिधि म्युटेंट संरचना भिन्न हैं, जिनका मूल माध्य त्रुटि मान 7.57 Å है। इसके अतिरिक्त, लीडन म्युटेंट APC के साथ एक कम स्थिर संयोग बनाता है, जिसमें FVa:APC का औसत बाइंडिंग ऊर्जा -77.2 kcal/mol और FVL:APC का औसत बाइंडिंग ऊर्जा -60.5 kcal/mol, दोनों 1000 ns के लिए अनुकरण किया गया है। इसके अलावा, हमने FVa:APC:PS और FVL:APC:PS का अनुकरण और विश्लेषण किया है, और यह निर्धारित किया है कि महत्वपूर्ण अमीनो एसिड बाइंडिंग साइट क्या हैं जो जंगली प्रकार और म्युटेंट कॉम्प्लेक्स के बीच इंटरैक्शन की विशेषता, तुलना और विपरीत करने में महत्वपूर्ण हैं। भविष्य के काम में FVa में लिगैंड द्वारा संरचनात्मक परिवर्तनों का मूल्यांकन शामिल है, ताकि कारक V लीडन उत्परिवर्तन के लिए एक विशिष्ट उपचार का संभावित विकास किया जा सके।