摘要:本研究旨在评估 ERBB2 G292R 突变对 EGF–EGFR–ERBB2 异二聚体构象与结合稳定性的影响。基于 AlphaFold3 构建野生型复合物结构并引入 G292R 突变,采用 Amber ff19SB 力场在水溶液中完成能量最小化、升温和平衡后进行 100 nss 分子动力学模拟。轨迹分析包括 RMSD/RMSF、主成分分析(PCA)、界面埋藏表面积(BSA)、阳离子–π 相互作用以及 MM/GBSA 结合自由能计算。结果表明,预测结构与实验解析模型高度一致(Cα RMSD= 0.987 Å),模拟期间两体系均保持整体稳定。与野生型相比,G292R 突变显著增加 EGFR–ERBB2 界面埋藏表面积并形成更稳定的阳离子–π 相互作用。MM/GBSA 结果显示突变体系结合自由能更有利(ΔΔG ≈ –3.77 kcal/mol),其中 Arg292 对界面稳定性贡献突出。综上, ERBB2 G292R 突变通过扩大界面接触面积、增强关键相互作用并降低结合自由能,从而明显提高 EGFR–ERBB2 异二聚体的构象稳定性。象稳定性。
Zhang et al. (Sun,) studied this question.