कोलोरेक्टल कैंसर में बायोमार्कर खोज के लिए अगली पीढ़ी का नैनोपार्टिकल वर्कफ़्लो

सारांश मानव प्लाज्मा कैंसर बायोमार्कर्स के परिसंचारी स्रोत के रूप में न्यूनतम आक्रामकता प्रदान करता है, लेकिन इसकी अत्यधिक प्रोटीन गतिशील श्रेणी और व्यक्ति-विशिष्ट भिन्नता कम मात्रा वाले ट्यूमर-उत्पन्न मार्करों का पता लगाने में बाधा डालती है। कोलोरेक्टल कैंसर (CRC) में, जहाँ प्रारंभिक पहचान, जोखिम वर्गीकरण और उपचार निगरानी प्रमुख अपर्याप्त आवश्यकताएँ हैं, ये विश्लेषणात्मक बाधाएँ नैदानिक अनुवाद को सीमित करती हैं। यहाँ, हम एक सिंगल-पार्टिकल संवर्धन वर्कफ़्लो प्रस्तुत करते हैं जो P2 नैनोपार्टिकल्स को iST सैंपल तैयारी और Spectronaut® 20 DIA विश्लेषण के साथ मिलाकर गहरी प्रोटिओम कवरेज, बेहतर मात्रात्मक सटीकता, और मानवीय EDTA-प्लाज्मा बायोमार्कर खोज में जैविक अंतर्दृष्टि को सक्षम करता है। एक पायलट अध्ययन से CRC और स्वस्थ नमूनों (प्रत्येक समूह में n=6) के मानव EDTA-प्लाज्मा नमूने P2-iST प्लाज्मा वर्कफ़्लो (PreOmics) का उपयोग करके संसाधित किए गए, जिसमें स्वामित्व वाले नैनोपार्टिकल्स का उपयोग किया गया जो कम मात्रा वाले प्रोटीनों का चयनात्मक रूप से पकड़ते हैं जबकि उच्च मात्रा की प्रजातियों को कम करते हैं। संवर्धित नमूनों को बाद में iST तकनीक (PreOmics) का उपयोग करके पचाया और शुद्ध किया गया, जो मानकीकृत पेप्टाइड उत्पादन सुनिश्चित करता है। पेप्टाइड्स को timsTOF HT (Bruker) पर dia-PASEF® मोड में विश्लेषित किया गया और Spectronaut® 20 (Biognosys) में directDIA+ फ्रेमवर्क के साथ डेटा संसाधित किया गया ताकि गहरी, मात्रात्मक प्रोफाइलिंग संभव हो। गैर-संवर्धित प्लाज्मा नमूनों की तुलना में, एकीकृत वर्कफ़्लो ने गहरी प्रोटिओम कवरेज और उच्च मात्रात्मक सटीकता (प्रतिलिपि के पार मीडियन प्रोटीन-स्तर CV 15%) प्रदान की। प्रमुख घटक और पदानुक्रमित क्लस्टरिंग विश्लेषण ने CRC और नियंत्रण नमूनों के बीच स्पष्ट भेद दर्शाया। कार्यात्मक संवर्धन ने रोग और नियंत्रण समूहों को अलग करने वाले विशिष्ट जैविक मार्गों को उजागर किया, जो वर्कफ़्लो की संवेदनशीलता और विवेचनात्मक क्षमता को दर्शाता है। P2-iST प्लाज्मा वर्कफ़्लो नैनोपार्टिकल-आधारित संवर्धन, मानकीकृत पाचन, और उन्नत DIA विश्लेषण को एकीकृत करता है ताकि गहरी, सटीक, और पुनरुत्पादनीय प्लाज्मा प्रोटिओम बनाई जा सके जो कोलोरेक्टल कैंसर में रोग-संबंधी जीवविज्ञान को प्रतिबिंबित करता है। परिसंचारी बायोमार्कर खोज में नई संभावनाओं को खोलकर, यह प्रारंभिक पहचान, आणविक उपप्रकार निर्धारण, पेशगौई, और उपचार निगरानी में अनुसंधान का समर्थन करता है। इसका स्केलेबल, स्वचालन-अनुकूल डिज़ाइन कोलोरेक्टल और अन्य कैंसरों में बड़े समूह की वैधता और दीर्घकालिक अध्ययनों को सक्षम बनाता है। उद्धरण प्रारूप: कैमरन एलिस, काथरिना लिम्म, सैंड्रा शैअर, रोलैंड ब्रुडरर, निल्स कुलाक। प्लाज्मा प्रोटिओमिक्स को बढ़ावा देना: कोलोरेक्टल कैंसर में गहरी और मात्रात्मक बायोमार्कर खोज के लिए अगली पीढ़ी का नैनोपार्टिकल संवर्धन वर्कफ़्लो सारांश। अमेरिकन एसोसिएशन फॉर कैंसर रिसर्च एनुअल मीटिंग 2026 के प्रोसिडिंग्स; भाग 1 (नियमित सारांश); 2026 अप्रैल 17-22; सैन डिएगो, CA। फिलाडेल्फिया (PA): AACR; Cancer Res 2026;86(7 Suppl):Abstract nr 7698।