लिगैंड डॉकिंग और बाइंडिंग साइट विश्लेषण PyMOL और Autodock/Vina के साथ

एक रिसेप्टर के बाइंडिंग साइट में छोटे अणु यौगिकों का डॉकिंग करना और जटिलता की बाइंडिंग एफ़िनिटी का अनुमान लगाना संरचना-आधारित औषधि डिज़ाइन प्रक्रिया का एक महत्वपूर्ण हिस्सा है। प्रोटीन/लिगैंड जटिलता की ताकत को निर्धारित करने वाले संरचनात्मक सिद्धांतों की गहन समझ के लिए, एक सटीक और तेज़ डॉकिंग प्रोटोकॉल और बाइंडिंग ज्यामितियों और इंटरएक्शन को विज़ुअलाइज़ करने की क्षमता अनिवार्य है। यहाँ हम लोकप्रिय आणविक ग्राफिक्स सिस्टम PyMOL और आणविक डॉकिंग सूट Autodock और Vina के बीच एक इंटरफ़ेस प्रस्तुत करते हैं और प्रदर्शित करते हैं कि डॉकिंग और विज़ुअलाइज़ेशन का संयोजन संरचना-आधारित औषधि डिज़ाइन प्रयासों में कैसे सहायता कर सकता है।