सेरोटोनिन क्लियरेंस इन विवो एंटी-डिप्रेसेंट के कारण सेरोटोनिन ट्रांसपोर्टर के डाउनरेगुलेशन द्वारा अधिक रूप से परिवर्तित होता है बजाए कि इस ट्रांसपोर्टर के तीव्र ब्लॉक के।

सेरोटोनिन का अपटेक, जो सेरोटोनिन ट्रांसपोर्टर (SERT) द्वारा मध्यस्थता किया जाता है, को चयनात्मक सेरोटोनिन पुनःअपटेक अवरोधकों (SSRIs) जैसे एंटी-डिप्रेसेंट द्वारा तीव्रता से अवरुद्ध किया जाता है, लेकिन ऐसा अवरोध चिकित्सीय सुधार की शुरुआत के समय के साथ संरेखित नहीं होता। SSRIs के साथ 21 दिनों का उपचार SERT का डाउनरेगुलेशन उत्पन्न करता है (Benmansour et al., 1999)। SERT डाउनरेगुलेशन का समय पाठ्यक्रम और SSRI सेरट्रालीन के साथ उपचार बंद करने के बाद इसके पुनर्प्राप्ति का समय पाठ्यक्रम की जांच की गई, जिसमें SERT बाइंडिंग साइटों को मापने के लिए ट्रिटिएटेड सायनोइमिप्रामाइन का उपयोग किया गया। यह निर्धारित करने के लिए कि क्या सेरट्रालीन के कारण SERT का डाउनरेगुलेशन और SERT कार्य में महत्वपूर्ण परिवर्तन होने का समय एक दूसरे के साथ संयुग्मित है, CA3 क्षेत्र में स्थानीय रूप से लागू 5-HT का क्लियरेंस in vivo इलेक्ट्रोकैमिस्ट्री का उपयोग कर प्राप्त किया गया। सेरट्रालीन के साथ 4 या 10 दिन के उपचार के बाद, SERT बाइंडिंग साइटों में बहुत कम कमी हुई (15-30%), और सेरट्रालीन-उपचारित चूहों में सेरोटोनिन के लिए क्रोनोएम्पेरोमेट्रिक सिग्नल नियंत्रण जानवरों से प्राप्त सिग्नलों के समान थे। इसके विपरीत, 15 दिनों के उपचार के बाद, जब SERT बाइंडिंग साइटों में 80% की महत्वपूर्ण कमी आई, 5-HT के क्लियरेंस में भारी कमी हुई। इसके अलावा, SERT डाउनरेगुलेशन के कार्यात्मक परिणाम क्रोनोएम्पेरोमेट्री द्वारा मापे गए थे, जो SSRIs द्वारा SERT के तीव्र अवरोध के बाद देखे गए परिणामों की तुलना में काफी अधिक थे। SERT बाइंडिंग साइटों में कमी SERT जीन अभिव्यक्ति की कमी का परिणाम नहीं है, जैसा कि इन सिटू हाइब्रिडाइजेशन मापों से स्पष्ट हुआ। SSRI-प्रेरित SERT का डाउनरेगुलेशन SSRIs के लिए नैदानिक प्रतिक्रिया का एक प्रमुख घटक हो सकता है।