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वेब्लोगो अनुक्रम लोगो उत्पन्न करता है, जो एक से अधिक अनुक्रम संरेखण के भीतर पैटर्न का ग्राफिकल प्रतिनिधित्व है। अनुक्रम लोग समग्र अनुक्रम समानता का एक समृद्ध और अधिक सटीक विवरण प्रदान करते हैं, जो सहमति अनुक्रमों की तुलना में अधिक जानकारीपूर्ण होते हैं और संरेखण के महत्वपूर्ण विशेषताओं को जल्दी से प्रकट कर सकते हैं, जो अन्यथा पहचानना कठिन होते हैं। प्रत्येक लोगो अक्षरों के ढेरों से बना होता है, प्रत्येक स्थिति के लिए एक ढेर। प्रत्येक ढेर की समग्र ऊंचाई उस स्थिति पर अनुक्रम संरक्षण को दर्शाती है (जो बाइट में मापी जाती है), जबकि ढेर के भीतर प्रतीकों की ऊंचाई उस स्थिति पर संबंधित एमीनो या न्यूक्लिक एसिड की सापेक्ष आवृत्ति को दर्शाती है। हाल ही में, वेब्लोगो को अतिरिक्त विशेषताओं और विकल्पों के साथenhanced किया गया है, ताकि एक सुविधाजनक और अत्यधिक कॉन्फ़िगर करने योग्य अनुक्रम लोगो जनरेटर प्रदान किया जा सके। एक कमांड लाइन इंटरफ़ेस और पूर्ण, ओपन वेब्लोगो स्रोत कोड स्थानीय स्थापना और कस्टमाइज़ेशन के लिए उपलब्ध है।
क्रूक्स एट अल। (मंगल,) ने इस प्रश्न का अध्ययन किया।