जनसंख्या-आधारित पुनः अनुक्रमण प्रकट करता है कि कृषि किए गए जौ का फूलने का समय अनुकूलन उपजाऊ उपत्यका के पूर्व में उत्पन्न हुआ

जीन पुनः अनुक्रमण और संघ विश्लेषण फसल पौधों में अनुकूली लक्षणों के विकास का अध्ययन करने के लिए नए अवसर प्रदान करते हैं। यहां हम फूलने के समय के अनुकूलन के आणविक आधार के एक घटक को पहचानने के लिए जौ के एक्सेसनों के एक व्यापक सेट पर इन उपकरणों को लागू करते हैं, जो पौधों के अस्तित्व के लिए महत्वपूर्ण एक लक्षण है। फूलने के समय में परिवर्तन को Ppd-H1 जीन में अनुक्रम-आधारित असमानताओं से संबंधित करने के लिए एक संघ-आधारित अध्ययन का उपयोग करते हुए, हम एक कारणात्मक असमानता (SNP48) की पहचान करते हैं जो जौ के फूलने के समय में देखे गए परिवर्तन के लिए जिम्मेदार है। यह असमानता भौगोलिक वितरण में अक्षांश-निर्भरता भी दिखाती है, जो उत्तर में अनुप्रतिक्रियात्मक रूप के प्रबल होने के साथ फेनोटाइप में अपेक्षित क्लाइनल परिवर्तन के अनुरूप है। Ppd-H1 हैप्लोटाइप के लिए तैयार किए गए नेटवर्क, वंशावली और पादप संबंधी पेड़ वन्य जौ और पालतू जौ के भूमि नस्लों में जनसंख्या संरचना को प्रकट करते हैं। इन जनसंख्या समूहों का स्थानिक वितरण यह संकेत करता है कि यूरोपीय भूमि नस्लों का फाइलोभौगोलिक विश्लेषण जौ की कृषि के नियोलीथिक प्रसार से संबंधित जानकारी प्रदान कर सकता है और पालतू जौ की उत्पत्ति के लिए भी निहितार्थ है, जिसमें अनुप्रतिक्रियात्मक ppd-H1 फेनोटाइप वाले भी शामिल हैं। SNP48 के अनुप्रतिक्रियात्मक संस्करण वाले हैप्लोटाइप वन्य जौ के एक्सेसनों में मौजूद हैं, जो संकेत करता है कि यूरोपीय भूमि नस्लों का अनुप्रतिक्रियात्मक फेनोटाइप वन्य जौ से उत्पन्न हुआ। उन वन्य एक्सेसनों के अनुप्रतिक्रियात्मक हैप्लोटाइप, जो भूमि नस्लों के सबसे करीब हैं, ईरान में पाए जाते हैं, एक ऐसे क्षेत्र में जो उपजाऊ उपत्यका के पूर्व में जौ को पालतू बनाने के लिए एक क्षेत्र के रूप में सुझावित किया गया है लेकिन जिसे पूर्व में यूरोपीय किस्मों की विविधता में अपेक्षाकृत कम योगदान देने के लिए सोचा गया था।