PhosphoSitePlus: मनुष्य और चूहा में प्रयोगात्मक रूप से निर्धारित पोस्ट-ट्रांसलेशनल मॉडिफिकेशन की संरचना और कार्य का अध्ययन करने के लिए एक व्यापक संसाधन

PhosphoSitePlus (http://www.phosphosite.org) एक खुला, व्यापक, मैन्युअल रूप से संकलित और इंटरैक्टिव संसाधन है जो मुख्य रूप से मानव और चूहा प्रोटीन के प्रयोगात्मक रूप से देखे गए पोस्ट-ट्रांसलेशनल मॉडिफिकेशन के अध्ययन के लिए है। इसमें 1,30,000 गैर-अतिरिक्त संशोधन साइटें शामिल हैं, मुख्यतः फॉस्फोरिलेशन, युबिक्विटिनिलेशन और एसिटिलेशन। इसका इंटरफेस स्पष्टता और नेविगेशन में आसानी के लिए डिज़ाइन किया गया है। होम पेज से, उपयोगकर्ता सरल या जटिल खोजें शुरू कर सकते हैं और रोग, ऊतक या सेल लाइन के अनुसार हाई-थ्रूपुट डेटा सेट ब्राउज़ कर सकते हैं। खोजों को विशेष उपचार, प्रोटीन प्रकार, डोमेन, सेलुलर कंपोनेंट्स, रोग, सेल प्रकार, सेल लाइन, ऊतक और अनुक्रम या मोटिफ द्वारा सीमित किया जा सकता है। कुछ क्लिक से उपयोगकर्ता सब्सट्रेट पृष्ठ या प्रोटीन पृष्ठों पर जा सकते हैं जहाँ साइट्स, अनुक्रम, डोमेन आरेख और संशोधित साइड-चेन की आणविक दृश्यता उपलब्ध है; साइट पृष्ठों पर जानकारी जहां संशोधित साइट विशिष्ट प्रोटीन और सेलुलर प्रक्रियाओं के कार्यों से संबंधित होती है; और संकलित जानकारी पृष्ठ जो एक रिकॉर्ड के विवरण को सारांशित करते हैं। संशोधित अवशेषों पर सक्रिय समूहों को रंगित करने वाले PyMOL और Chimera स्क्रिप्ट डाउनलोड किए जा सकते हैं। प्रोटिओमिक विश्लेषणों को सुविधाजनक बनाने के लिए सुविधाओं में संशोधन साइट डाउनलोड, किनेज-सब्सट्रेट डेटा सेट, अनुक्रम लोगो जनरेटर, एक Cytoscape प्लगइन और PhosphoSitePlus® में किनेज-सब्सट्रेट इंटरैक्शन के पाथवे विज़ुअलाइज़ेशन के लिए BioPAX डाउनलोड शामिल हैं।