पेप्टाइड्स के कम-ऊर्जा टकराव-प्रेरित विघटन स्पेक्ट्रा की भविष्यवाणी

एक गतिशील मॉडल, जो पेप्टाइड विघटन के "मोबाइल प्रोटॉन" मॉडल पर आधारित है, को क्वाड्रूपोल आयन ट्रैप मास स्पेक्ट्रोमीटर में विघटित पेप्टाइड्स के कम-ऊर्जा टकराव-प्रेरित विघटन (CID) स्पेक्ट्रा का मात्रात्मक अनुकरण करने के लिए विकसित किया गया। इस मॉडल में साहित्य में वर्णित अधिकांश विघटन मार्ग शामिल हैं, इसके साथ कुछ अतिरिक्त मार्ग लेखक के अवलोकनों के आधार पर। मॉडल को ज्ञात पेप्टाइड्स के CID स्पेक्ट्रा की भविष्यवाणियों के लिए मापदंडों को अनुकूलित करके प्रशिक्षित किया गया। एक सर्वश्रेष्ठ मापदंडों का सेट अनुकूलित किया गया ताकि प्रशिक्षण डेटा सेट में अनुकरण किए गए स्पेक्ट्रा और प्रयोगात्मक स्पेक्ट्रा के बीच सबसे अच्छा मेल प्राप्त किया जा सके। CID स्पेक्ट्रा अनुकरण में उपयोग किए गए गणितीय मॉडल और संबंधित अनुकूलित मापदंड सेट के प्रदर्शन को उन ज्ञात पेप्टाइड्स के लिए भविष्यवाणियाँ उत्पन्न करके मूल्यांकित किया गया, जिन्हें प्रशिक्षण डेटा सेट में शामिल नहीं किया गया था। यह दिखाया गया कि मॉडल 2000 u तक के एकल और दोहरी चार्ज वाले पेप्टाइड मूल आयनों के लिए विभाजन आयन तीव्रताओं में उचित सटीकता के साथ पेप्टाइड CID स्पेक्ट्रा की भविष्यवाणी करने में सक्षम है। टकराव-प्रेरित पेप्टाइड विघटन प्रक्रिया की अंतर्दृष्टि प्राप्त करने के लिए अनुकूलित मापदंड सेट का मूल्यांकन किया गया।