एमीन्स के लिए OPLS ऑल-एटम मॉडल:  एमीन्स हाइड्रेशन समस्या का समाधान

क्लासिकल फोर्स-फील्ड पैरामीटर मुख्य रूप से शुद्ध तरल पदार्थों के लिए प्रयोगात्मक डेटा और गैस-फेज एब इनिटियो गणनाओं से हाइड्रोजन-बाँध ताकतों के लिए फिट करके विकसित किए गए हैं। इसके परिणामस्वरूप प्राप्त पैरामीटर का उपयोग अमोनिया, मिथाइलअमिन, डाईमेथिलअमिन, और ट्राइमेथिलअमिन के लिए हाइड्रेशन की सापेक्ष मुक्त ऊर्जा की गणना करने के लिए किया गया, जिसमें मुक्त ऊर्जा विक्षेपण गणनाएँ मोंटे कार्लो सिमुलेशन (MC/FEP) में की गईं। परिणाम, जिसमें यह तथ्य शामिल है कि सबसे अनुकूल ΔGhyd मिथाइलअमिन के लिए होता है, प्रयोगात्मक डेटा के साथ उत्कृष्ट सहमति में हैं, कई पूर्व कंप्यूटर रिपोर्टों के विपरीत। गणनाएँ पानी में दो विरोधी प्रवृत्तियों का खुलासा करती हैं: हाइड्रोजन-बाँध स्वीकृति से बढ़ी हुई योगदान और एमीन्स के मिथाइलीकरण के साथ हाइड्रोजन-बाँध दान से घटती हुई योगदान। हाइड्रोजन-बाँध ताकतों का उचित संतुलन, जो OPLS-AA फोर्स फील्ड के साथ प्राप्त किया जाता है, हाइड्रेशन की मुक्त ऊर्जा के सही क्रम के लिए आवश्यक है। इसके बाद, तेरह अतिरिक्त एमीन्स के शुद्ध तरल पदार्थों के लिए MC सिमुलेशन ने फोर्स फील्ड की स्थानांतरणीयता को प्रदर्शित किया, जो मूल पैरामीटरकरण में शामिल नहीं थे। इन सिमुलेशनों में अलिफैटिक के साथ-साथ चक्रीय और सुगंधित एमीन्स का सम्मिलित किया गया। इसके अलावा, कम ध्रुवीय वातावरण के लिए फोर्स फील्ड की उपयुक्तता को सॉल्वेशन की सापेक्ष मुक्त ऊर्जा और क्लोरोफॉर्म में लॉग P मानों की MC/FEP गणनाओं के माध्यम से पुष्टि की गई। यह स्पष्ट है कि एमीन्स के लिए क्लासिकल फोर्स फील्ड में पूर्व की समस्याएँ बस उप-आदर्श पैरामीटरकरण का परिणाम थीं, न कि किसी महत्वपूर्ण आवश्यकताओं की कमी जैसे कि स्पष्ट ध्रुवीकरण की अनुपस्थिति।