यूनिप्रोब: प्रोटीन-डीएनए इंटरैक्शन पर प्रोटीन बाइंडिंग माइक्रोएरे डेटा का एक ऑनलाइन डेटाबेस

यूनिप्रोब (यूनिवर्सल पीबीएम रिसोर्स फॉर ओलिगोन्यूक्लोटाइड बाइंडिंग इवैल्यूएशन) डेटाबेस ऐसी डेटा को होस्ट करता है जिसे यूनिवर्सल प्रोटीन बाइंडिंग माइक्रोएरे (पीबीएम) तकनीक के द्वारा उत्पन्न किया गया है, जो प्रोटीन के इन विट्रो डीएनए-बाइंडिंग विशिष्टताओं पर केंद्रित है। यूनिप्रोब डेटाबेस का यह प्रारंभिक रिलीज प्रोटीनों के सभी संभावित अनुक्रम विविधताओं ('शब्दों') की लंबाई k ('k-мерस') के लिए पसंदों पर व्यापक पीबीएम डेटा को पहुंचाने का एक केंद्रीकृत संसाधन प्रदान करता है, साथ ही स्थिति वजन मैट्रिक्स (पीडब्ल्यूएम) और k-мер डेटा के ग्राफिकल अनुक्रम लोगो प्रस्तुतियों को भी। कुल मिलाकर, डेटाबेस 175 से अधिक गैर-रिडंडेंट प्रोटीनों के लिए डीएनए-बाइंडिंग डेटा को विभिन्न जीवों के संग्रह से होस्ट करता है, जिनमें प्रोकेरियोट वाइब्रियो हार्वेई, यूकेरियोट मलेरियल परजीवी प्लास्मोडियम फल्सीपरम, परजीवी एपिकॉम्प्लेक्षन क्रिप्टोस्पोरिडियम पर्सम, खमीर सैकरोमीसेज सेरेविसियाई, कीड़ा कैनोर्बैडिटीस एलिगन्स, चूहा और मानव शामिल हैं। वर्तमान वेब टूल्स में टेक्स्ट-आधारित खोज, उपयोगकर्ता द्वारा दर्ज किए गए डेटा और डेटाबेस पीडब्ल्यूएम के बीच मोटिफ समानता का आकलन करने का एक फ़ंक्शन और उपयोगकर्ता द्वारा दर्ज किए गए न्यूक्लियोटाइड अनुक्रमों के साथ संभावित बाइंडिंग साइट्स को खोजने का एक फ़ंक्शन शामिल है। यूनिप्रोब डेटाबेस http://thebrain.bwh.harvard.edu/uniprobe/ पर उपलब्ध है।