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10 प्रजातियों के मीथनोजेनिक बैक्टीरिया से 16S राइबोसोमल RNA को T(1) RNase पाचन द्वारा उत्पादित ओलिगोन्यूक्लियोटाइड्स के संदर्भ में विशेषता दी गई है। इन आंकड़ों का तुलनात्मक विश्लेषण यह दर्शाता है कि मीथनोजेन एक विशिष्ट फाइलेजेनिक समूह का निर्माण करते हैं जिसमें दो प्रमुख विभाजन हैं। ये जीव केवल सामान्य बैक्टीरिया के साथ दूर-दूर तक के संबंध में प्रतीत होते हैं।
Fox et al. (Sat,) ने इस प्रश्न का अध्ययन किया।