आईसीपी में संदिग्ध फेफड़ों के संक्रमण के मामले में, ptNGS ने CMTs की तुलना में रोगज़नक्व पहचान में काफी वृद्धि की है और mNGS के समान नैदानिक प्रदर्शन प्रदर्शित किया है। अनुक्रमण परिणामों की सावधानीपूर्वक नैदानिक व्याख्या की आवश्यकता होती है, क्योंकि श्वसन नमूनों में संक्रमण और उपनिवेश को स्पष्ट रूप से अलग करना कठिन है। अन्वेषणात्मक सूक्ष्मजीव विश्लेषणों ने फेफड़ों की सूक्ष्मजीव पारिस्थितिकी में संक्रमण से संबंधित परिवर्तनों का सुझाव दिया है जो आगे की प्रमाणीकरण के योग्य हैं।
Wu तथा सहयोगियों (गुरुवार,) ने इस प्रश्न का अध्ययन किया।