स्प्लाइस आइसोफॉर्म्स के क्रियात्मक महत्व का आकलन

संदेश RNA का वैकल्पिक स्प्लाइसिंग परिपक्व ट्रांसक्रिप्ट्स की एक श्रृंखला उत्पन्न कर सकता है, लेकिन यह स्पष्ट नहीं है कि कितने क्रियात्मक रूप से प्रासंगिक प्रोटीन आइसोफॉर्म्स उत्पन्न करते हैं। प्रोटेमिक्स विश्लेषणों में वैकल्पिक प्रोटीनों के लिए केवल सीमित सबूत हैं और जनसंख्या आनुवंशीय विविधता के अध्ययन के आंकड़े संकेत करते हैं कि अधिकांश वैकल्पिक एक्सन न्यूट्रली विकसित हो रहे हैं। यह निर्धारित करना कि कौन से ट्रांसक्रिप्ट जैविक रूप से महत्वपूर्ण आइसोफॉर्म्स का उत्पादन करते हैं, आइसोफॉर्म कार्यप्रणाली को समझने और सोमेटिक उत्परिवर्तनों और जर्मलाइन विविधताओं के वास्तविक प्रभाव को व्याख्यायित करने के लिए कुंजी है। यहां हमने स्प्लाइस आइसोफॉर्म्स के क्रियात्मक महत्व को वर्गीकृत करने के लिए एक विधि विकसित की है, TRIFID। TRIFID को बड़े पैमाने पर प्रोटेमिक्स विश्लेषणों में पहचाने गए आइसोफॉर्म्स पर प्रशिक्षित किया गया था और यह इन जैविक रूप से महत्वपूर्ण स्प्लाइस आइसोफॉर्म्स को उच्च विश्वास के साथ भेद करता है। एल्गोरिदम द्वारा क्रियात्मक रूप से महत्वपूर्ण के रूप में प्रतिरूपित आइसोफॉर्म्स में मापनीय क्रॉस प्रजाति संरक्षण और काफी कम टूटे हुए कार्यात्मक डोमेन्स थे। इसके अतिरिक्त, ये कार्यात्मक रूप से महत्वपूर्ण प्रोटीन आइसोफॉर्म्स को कोड करने वाले एक्सन शुद्धिकारी चयन के अंतर्गत हैं, जबकि निम्न स्कोरिंग ट्रांसक्रिप्ट्स के एक्सन मुख्यतः न्यूट्रली विकसित होते हुए प्रतीत होते हैं। TRIFID मानव जीनोम के लिए विकसित किया गया है, लेकिन इसे सिद्धांत में अन्य अच्छी तरह से एनोटेटेड प्रजातियों पर लागू किया जा सकता है। हमें विश्वास है कि यह विधि वैकल्पिक स्प्लाइसिंग के सेलुलर महत्व पर मूल्यवान अंतर्दृष्टियाँ उत्पन्न करेगी।