स्वचालित कमी और व्याख्या

यहां पेप्टाइड्स और प्रोटीन के जटिल द्रव्यमान स्पेक्ट्रा पर एक पूर्ण स्वचालित कंप्यूटर एल्गोरिदम लागू किया गया है। यह विधि स्पेक्ट्रम में संभावित आइसोटोपिक क्लस्टर को खोजने के लिए एक घटाव पीक खोज रूटीन का उपयोग करती है, जो प्राथमिक चार्ज निर्धारण के लिए पिछले फूरियर ट्रांसफॉर्म/पैटर्सन विधि और सबसे प्रचुर आइसोटोपिक पीक के m/z निर्धारण के लिए सिद्धांतिक रूप से व्युत्पन्न आइसोटोपिक प्रचुरता वितरण के लिए सबसे कम-वर्ग फिटिंग की विधि का संयोजन करती है, और इस निर्धारण की सांख्यिकीय विश्वसनीयता। यदि एक पूर्वानुमानित प्रोटीन अनुक्रम उपलब्ध है, तो प्रत्येक ऐसे m/z मान की जाँच अनुक्रम टुकड़े के रूप में नियुक्ति के लिए की जाती है। उच्च पीक घनत्व वाले स्पेक्ट्रा के लिए आधार रेखा और शोर चौड़ाई के सटीक निर्धारण के लिए एक नई सिग्नल-टू-नॉइज़ गणना प्रक्रिया विकसित की गई है। 2 घंटे में, कार्यक्रम ने 191 kDa प्रोटीन के GluC पचाने के स्पेक्ट्रम में 581 द्रव्यमान मानों का प्रतिनिधित्व करने वाले 824 आइसोटोपिक क्लस्टर की पहचान की; यह पहले उपयोग की गई अत्यधिक थकाऊ ऑपरेटर-लागू की गई विधि द्वारा पाए गए द्रव्यमान मानों की संख्या से >50% अधिक है। यह कार्यक्रम बड़े अणुओं की श्रेणियों, जिसमें DNA और पॉलिमर शामिल हैं, के लिए सामान्यतः लागू किया जाना चाहिए। स्पेक्ट्रा का गहन उच्च गुणवत्ता विश्लेषण हॉर्न (THRASH) द्वारा कार्यक्रम के क्रिया के रूप में प्रस्तावित है।