एक नया डीएनए-बाइंडिंग डोमेन जो एकल जिंक फिंगर मोटिफ बना सकता है

MNB1a एक डीएनए-बाइंडिंग प्रोटीन है जो मकई से है और काउलिफ्लॉवर मोज़ेक वायरस के 35S प्रॉमोटर के साथ इंटरैक्ट करता है। इस प्रोटीन ने किसी अन्य डीएनए-बाइंडिंग प्रोटीन के साथ महत्वपूर्ण समानताएँ नहीं दिखाई और MNB1a एक बहु-जेनेटिक परिवार का सदस्य प्रतीत होता है। इस अध्ययन में, MNB1a जिस जीन परिवार से संबंधित है, से cDNAs का पृथककरण एक अनोखा संरक्षित डोमेन दिखाता है, जिसे यहाँ Dof डोमेन कहा जाता है, जिसमें एकल परिवर्तनीय जिंक फिंगर के लिए एक नया सिस्टीन-समृद्ध मोटिफ होता है। Dof डोमेन का अमीनो एसिड अनुक्रम और इस डोमेन में सिस्टीन अवशेषों की व्यवस्था ज्ञात जिंक फिंगर मोटिफों से भिन्न है। हालाँकि, Dof डोमेन को एक डीएनए-बाइंडिंग डोमेन के रूप में दर्शाया गया था जिसमें क्रियाकलाप के लिए Zn2+ आयनों की आवश्यकता थी। सिस्टीन अवशेषों में उत्परिवर्तन ने MNB1a की डीएनए-बाइंडिंग क्रिया को समाप्त कर दिया। इसलिए, Dof डोमेन को एक नए जिंक फिंगर मोटिफ के रूप में वर्गीकृत किया जा सकता है। इसके अतिरिक्त, साउदर्न ब्लॉट विश्लेषण और डीएनए डेटाबेस का सर्वेक्षण यह सुझाव देता है कि Dof डोमेन वाले प्रोटीन अन्य यूकैरियोट्स में, कम से कम पौधों की साम्राज्य में हो सकते हैं।