मैसेंजर RNA (mRNA) तकनीक बायोमेडिसिन में बहुत संभावनाएं रखती है; हालांकि, इसकी चिकित्सीय प्रभावकारिता काफी हद तक ट्रांसलेशन दक्षता और mRNA अनुक्रमों की इन विवो (in vivo) स्थिरता पर निर्भर करती है, जो दोनों कोडिंग और नॉन-कोडिंग क्षेत्रों के बीच गतिशील अंतःक्रियाओं द्वारा नियंत्रित होती हैं। मौजूदा अनुकूलन दृष्टिकोण आमतौर पर व्यक्तिगत अनुक्रम घटकों पर ध्यान केंद्रित करते हैं और उनमें वैश्विक, सहक्रियात्मक अनुकूलन की क्षमता का अभाव होता है। इसके अलावा, लंबे अनुक्रमों को प्रोसेस करते समय या पुनरावृत्तीय अनुक्रम शोधन का समर्थन करते समय उनका प्रदर्शन अक्सर सीमित होता है। इन चुनौतियों से पार पाने के लिए, हम फुल-लेंथ mRNA अनुक्रम डिज़ाइन के लिए एक एकीकृत और व्याख्या योग्य इन सिलिको (in silico) फ्रेमवर्क का प्रस्ताव करते हैं, जो CDS अनुकूलन, UTR निर्माण और डिग्रेडेशन मॉडलिंग को एकीकृत करता है। रेस्पिरेटरी सिंसिशियल वायरस (RSV) वैक्सीन डिज़ाइन पर आधारित इन सिलिको केस अध्ययनों से पता चला है कि mRNASyner ने ट्रांसलेशनल एक्सेसिबिलिटी और संरचनात्मक स्थिरता के बीच एक अनुकूल संतुलन हासिल किया है। इस प्रकार mRNASyner फुल-लेंथ mRNA अनुक्रमों के डिज़ाइन को सक्षम बनाता है, लंबे अनुक्रम अनुकूलन का समर्थन करता है, और पर्सनलाइज़्ड mRNA थेरेप्यूटिक्स के विकास के लिए एक नया समाधान प्रस्तुत करता है।
Gu et al. (Thu,) ने इस प्रश्न का अध्ययन किया।