संक्रामक अणुओं के cis-trans फोटोआइसोमेराइजेशन को चलाने वाले समन्वित प्रतिच्छेदन की संरचना¶

उच्च-स्तरीय अभ इनीशिओ गणनाएँ दिखाती हैं कि स्वायत्त स्थितियों के तहत कार्बनिक अणुओं का सिंगलेट फोटोकेमिकल cis-trans आइसोमेराइजेशन दो भिन्न यांत्रिकों के अनुसार हो सकता है। इन यांत्रिकों की पहचान उनके समन्वित प्रतिच्छेदन नलियों की विभिन्न संरचनाओं द्वारा की जाती है जो फोटोउत्पाद निर्माण को नियंत्रित करती हैं। गैरध्रुवीय (जैसे हाइड्रोकार्बन) पॉलीइन्स में सबसे निचली नली एक (CH)3 काइंक से मेल खाती है जिसमें दोनों डबल और निकटवर्ती सिंगल बांड मुड़े हुए होते हैं, जिससे हुला-ट्विस्ट (HT) आइसोमेराइजेशन शुरू हो सकता है। दूसरी ओर, प्रोटोनितेड शिफ़ बेस (PSB) जैसे ध्रुवीय समन्वित प्रणालियों में नली एक मात्र मुड़ा हुआ डबल बांड दिखाती है। नलियों से प्रस्थान करते समय ग्राउंड-स्टेट विश्रांतिक पथ यह संकेत देते हैं कि HT गति गैरध्रुवीय समन्वित प्रणालियों में हो सकती है, लेकिन साथ ही यह भी कि सिंगल-बांड मुड़ने को वापस मोड़ा जा सकता है, जबकि PSB जैसे मुक्त समन्वित ध्रुवीय अणुओं में एक-बांड फ्लिप तंत्र शुरू से ही प्रमुख होता है। उपलब्ध प्रयोगात्मक साक्ष्य या तो इन पूर्वानुमानों का समर्थन करते हैं या कम से कम उनके साथ संगत हैं।