DASHR 2.0: मानव छोटे गैर-कोडिंग RNA जीन और परिपक्व उत्पादों का एकीकृत डेटाबेस

प्रेरणा: छोटे गैर-कोडिंग RNA (sncRNAs, 800 संकलित प्रयोग ENCODE और GEO/SRA से विभिन्न RNA-seq प्रोटोकॉल के लिए GRCh38/hg38 और GRCh37/hg19 असेंबली के लिए DASHR में एकीकृत हैं। इसके अलावा, DASHR पहला ऐसा डेटाबेस है जिसमें ज्ञात और नए, पहले से अज्ञात sncRNA लोकेस शामिल हैं जिन्हें असंयमित विभाजन द्वारा पहचाना गया है (कुल 1 678 800 के साथ 13 गुना अधिक लोकेस)। इसके अतिरिक्त, DASHR v2.0 में गैर-छोटे RNA जीन और अन्य जीनोमिक विशेषताओं (लंबे गैर-कोडिंग RNAs, mRNAs, प्रमोटर्स, दोहराव) के लिए >3 200 000 टिप्पणियां जोड़ी गई हैं। आगे बढ़ते हुए, DASHR v2.0 एक बेहतर उपयोगकर्ता इंटरफ़ेस, इंटरैक्टिव प्रयोग-प्रति-लोकेस तालिका दृश्य, sncRNA लोकेस को जैविक विशेषताओं द्वारा छांटने और फ़िल्टर करने की सुविधा प्रदान करता है। सभी टिप्पणियां और एक्सप्रेशन जानकारी सीधे डाउनलोड करने योग्य और UCSC जीनोम ब्राउज़र ट्रैक्स के रूप में सुलभ हैं। उपलब्धता और कार्यान्वयन: DASHR v2.0 मुफ्त में उपलब्ध है https://lisanwanglab.org/DASHRv2. पूरक जानकारी: पूरक डेटा Bioinformatics ऑनलाइन पर उपलब्ध हैं।