मानव वॉन विलिब्रांड कारक जीन और पैसुडोजीन: संरचनात्मक विश्लेषण और पॉलीमरेज़ चेन प्रतिक्रिया द्वारा विभेदन

क्रोमोसोम 12 पर स्थित वॉन विलिब्रांड कारक जीन का संरचनात्मक विश्लेषण क्रोमोसोम 22q11-13 पर एक आंशिक असंसाधित पैसुडोजीन की उपस्थिति के कारण जटिल है। वॉन विलिब्रांड कारक पैसुडोजीन और संबंधित जीन के खंडों की संरचना का निर्धारण किया गया, और वॉन विलिब्रांड कारक जीन और पैसुडोजीन अनुक्रमों के त्वरित भेदभाव के लिए विधियाँ विकसित की गईं। पैसुडोजीन की लंबाई 21-29 किलोबेस है और यह वॉन विलिब्रांड कारक जीन के 12 एक्सॉन्स (एक्सॉन्स 23-34) से संबंधित है। जीन और पैसुडोजीन के लगभग 21 किलोबेस अनुक्रमित किए गए, जिसमें पैसुडोजीन की 5' सीमा शामिल है। पैसुडोजीन की 3' सीमा जीन के इंटरॉन 34 के अनुरूप 8-kb क्षेत्र के भीतर स्थित है। स्प्लाइस साइट और नॉनसेंस म्यूटेशन की उपस्थिति सुझाव देती है कि पैसुडोजीन कार्यात्मक ट्रांसक्रिप्ट उत्पन्न नहीं कर सकता। पैसुडोजीन जीन से न्यूक्लियोटाइड अनुक्रम में लगभग 3.1% भिन्नता रखता है। यह हाल के विकासात्मक उत्पत्ति को सुझाव देता है जो लगभग 19-29 मिलियन वर्ष पहले है, जब मानव और वानर बंदरों से भिन्न हुए थे। कई पुनरावर्ती अनुक्रमों की पहचान की गई, जिसमें 4 एएलयू, एक लाइन-1, और कई छोटे सरल अनुक्रम दोहराव शामिल हैं। इनमें से कई सरल दोहराव जीन और पैसुडोजीन के बीच लंबाई में भिन्न होते हैं और इन लोकेस को भेदने के लिए उपयोगी मार्कर्स प्रदान करते हैं। जीन और पैसुडोजीन के बीच अनुक्रम भिन्नताओं का उपयोग पॉलीमरेज़ चेन प्रतिक्रिया में उपयोग के लिए ओलिगोन्यूक्लियोटाइड प्राइमर तैयार करने के लिए किया गया ताकि वॉन विलिब्रांड कारक जीन या पैसुडोजीन से एक्सॉन्स 23-34 के अनुरूप अनुक्रमों को चयनात्मक रूप से बढ़ावा दिया जा सके। यह विधि वॉन विलिब्रांड रोग से ग्रस्त मरीजों में जीन दोषों के विश्लेषण के लिए उपयोगी है, बिना पैसुडोजीन में समान अनुक्रमों के हस्तक्षेप के।