मानव थायमिन DNA ग्लाइकोसिलेज़ द्वारा 5-हलोमिनेटेड उरासिल का उच्छेदन

थायमिन DNA ग्लाइकोसिलेज़ (TDG) G.T मिसपैक्स से थायमिन को उच्छेदित करता है और CpG.X संदर्भ में घावों के प्रति प्राथमिकता के साथ विभिन्न प्रकार के क्षतिग्रस्त आधार (X) को हटा देता है। हमने हाल ही में रिपोर्ट किया कि मानव TDG तेजी से 5-हलोमिनेटेड उरासिल को उच्छेदित करता है, जिनकी गतिविधि CpG.FU, CpG.ClU, और CpG.BrU के लिए CpG.T की तुलना में बहुत अधिक होती है। यहां हम U, T, FU, ClU, और BrU के लिए उच्छेदन गतिविधि पर CpG संदर्भ को परिवर्तित करने के प्रभावों का परीक्षण करते हैं। हम दिखाते हैं कि G.X सब्सट्रेट्स के लिए अधिकतम गतिविधि (k(max)) 5' बेस जोड़ी पर काफी निर्भर करती है। उदाहरण के लिए, CpG.ClU की तुलना में TpG.ClU, GpG.ClU, और ApG.ClU के लिए क्रमशः 6-, 11-, और 82-गुणा k(max) घटता है। दूसरे G.X सब्सट्रेट्स के लिए, 5'-पड़ोसी प्रभाव एक समान प्रवृत्ति रखते हैं लेकिन उनके आयाम में भिन्नता होती है। किसी भी 5'-फ्लैंकिंग जोड़ी के साथ G.FU, G.ClU, और G.BrU के लिए गतिविधि मिलती है और अधिकांश मामलों में CpG.T गतिविधि को महत्वपूर्ण रूप से पार कर जाती है। ध्यान देने योग्य बात यह है कि मानव TDG गतिविधि A.X के लिए G.X जोड़ों की तुलना में 10(2.3)-10(4.3)-गुणा कम हो जाती है और C.G के अलावा 5' जोड़ी वाले A.X जोड़ों के लिए और भी कम हो जाती है। 5' जोड़ी और/या विपरीत आधार (G.X बनाम A.X) को परिवर्तित करने का प्रभाव उन सब्सट्रेट्स के लिए अधिक होता है जो बड़े होते हैं (ब्रोमो-деऑक्सीयूरिडिन, dT) या जिनका N-ग्लाइकोसिडिक बंधन अधिक स्थिर होता है (जैसे dT)। थायमिन के उच्छेदन के लिए सबसे बड़े CpG संदर्भ प्रभाव देखे जाते हैं। हम मानव TDG की भूमिका पर चर्चा करते हैं जो ClU और BrU के DNA में समावेश के सायटोटॉक्सिक प्रभावों में हो सकती है, जो सूजन संबंधी स्थितियों के तहत हो सकता है और FU के सायटोटॉक्सिसिटी में, जो एक व्यापक रूप से प्रयुक्त एंटी-कैंसर एजेंट है।