3Drefine: प्रोटीन संरचना सुधार के लिए एक इंटरैक्टिव वेब सर्वर

3Drefine एक इंटरैक्टिव वेब सर्वर है जो प्रोटीन संरचना सुधार के लिए लगातार और कम्प्यूटेशनली प्रभावी है, जिसमें वेब-आधारित सांख्यिकीय और दृश्यात्मक विश्लेषण करने की क्षमता है। 3Drefine सुधार प्रोटोकॉल हाइड्रोजन बंधन नेटवर्क के दोहरावीय अनुकूलन का उपयोग करता है, जिसे कम्पोजिट भौतिकी और ज्ञान-आधारित बल क्षेत्रों के साथ एकीकृत किया गया है, ताकि अनुकूलित मॉडल पर आणविक स्तर की ऊर्जा न्यूनतमता सीधे की जा सके। इस पद्धति का व्यापक मूल्यांकन ब्लाइंड CASP प्रयोगों और बड़े पैमाने पर विविध बेंचमार्क डेटा सेट पर किया गया है और यह प्रारंभिक संरचना पर वैश्विक और स्थानीय संरचनात्मक गुणवत्ता मापों में लगातार सुधार प्रदर्शित करता है। 3Drefine वेब सर्वर पाठ या फ़ाइल इनपुट सबमिशन, ईमेल सूचनाएं, प्रदत्त उदाहरण सबमिशन के माध्यम से प्रोटीन संरचना सुधार को सुविधाजनक बनाता है और बिना किसी पंजीकरण आवश्यकता के स्वतंत्र रूप से उपलब्ध है। सर्वर विभिन्न ऊर्जा और सांख्यिकीय प्रतिक्रिया के माध्यम से सबमिशनों का व्यापक विश्लेषण भी प्रदान करता है और JSmol ऐपलेट के माध्यम से कई सुधारित मॉडलों का इंटरैक्टिव दृश्य प्रस्तुत करता है, जिसमें कई प्रोटीन मॉडल विश्लेषण उपकरण होते हैं। यह वेब सर्वर कई उपयोगकर्ताओं द्वारा व्यापक परीक्षण और उपयोग किया गया है। नतीजतन, 3Drefine वेब सर्वर समुदाय के लिए आसानी से उपलब्ध एक उपयोगी उपकरण प्रदान करता है। 3Drefine वेब सर्वर को सार्वजनिक रूप से उपलब्ध कराया गया है: http://sysbio.rnet.missouri.edu/3Drefine/।