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मेसिवली-पैरल सीक्वेंसिंग की संवेदनशीलता ने यह पुष्टि की है कि अधिकांश कैंसर ओलिगोक्लोनल होते हैं, जिसमें निओप्लास्टिक कोशिकाओं की उप-जनसंख्या में भिन्न उत्परिवर्तन होते हैं। इस क्लोनल आर्किटेक्चर का एक बारीक दृष्टिकोण ट्यूमर की विविधता, विकास और उपचार प्रतिक्रिया में अंतर्दृष्टि प्रदान करता है, जिनका सभी का नैदानिक महत्व हो सकता है। एकल ट्यूमर विश्लेषण पहले से ही इन घटनाओं को समझने में योगदान देता है। हालांकि, अस्पष्ट उपक्लोन अक्सर अतिरिक्त रोगी नमूनों (जैसे, पुनर relapse पर या उपचार के बाद एकत्रित किए गए) द्वारा प्रकट होते हैं, जो यह इंगित करता है कि एक ट्यूमर का सटीक वर्णन करने के लिए उसी रोगी से कई नमूनों का विश्लेषण करना आवश्यक है। इस आवश्यकताका समाधान प्रदान करने के लिए, हम SciClone प्रस्तुत करते हैं, एक संगणकीय विधि जो उपक्लोन की संख्या और जनसांख्यिकीय संरचना की पहचान करती है, जो समैटिक उत्परिवर्तन के रूपांतर एलील आवृत्तियों का विश्लेषण करके होती है। हम इसका उपयोग तीव्र मायलॉइड ल्यूकेमिया और स्तन कैंसर के नमूनों में उपक्लोन का पता लगाने के लिए करते हैं, जो, हालांकि रोग के प्रारंभ में मौजूद होते हैं, एकल प्राथमिक ट्यूमर नमूने से स्पष्ट नहीं होते हैं। ऐसा करके, हम ट्यूमर के विकास की ट्रैकिंग कर सकते हैं और उन कोशिकाओं के स्थानिक उत्पत्ति की पहचान कर सकते हैं जो उपचार का विरोध कर रही हैं।
मिलर और अन्य (गुरुवार,) ने इस प्रश्न का अध्ययन किया।