c-Ets-1 प्रोटीन द्वारा विशेष रूप से पहचाने जाने वाले DNA अनुक्रमों में न्यूक्लियोटाइड प्राथमिकताओं की पहचान

प्रोटोऑन्कोजेन Ets-1 c-Ets जीनों के परिवार का एक सदस्य है जिसे मूल रूप से avian erythroblastosis virus E26 के v-ets जीन के साथ अनुक्रम समानता के माध्यम से पहचाना गया था। Ets-समान कारक एक संरक्षित 85 एमिनो एसिड डोमेन द्वारा caractérisé होते हैं जो पुरिन समृद्ध DNA अनुक्रमों के साथ बंधने के लिए आवश्यक प्रतीत होता है। Ets-1 के साथ बंधने वाले अनुक्रमों का चयन एक यादृच्छिक ओलिगोन्यूक्लियोटाइड पूल से इम्यूनोप्रेसीपिटेशन द्वारा किया गया और पॉलीमरेज़ चेन रिएक्शन का उपयोग करके बढ़ाया गया। इस प्रक्रिया द्वारा समृद्ध ओलिगोन्यूक्लियोटाइड को प्लाज्मिड में क्लोन किया गया और अनुक्रमित किया गया। DNA अनुक्रमों का संरेखण लगभग 1.4:1 अनुपात में GGAA और GGAT कोर प्रकट करता है। पसंदीदा अनुक्रमों को GGAW कोर के 5' और 3' दोनों ओर पहचाना गया, जिससे बंधने वाली साइट को ACMGGAWRTT में बढ़ाया गया। GGAA और GGAT कोर से जुड़े फ्लैंकिंग अनुक्रमों का विश्लेषण ऐसे भिन्नताओं को प्रकट करता है जो GGAT कोर वाले बंधने वाले स्थलों की सामान्य रूप से कम अफिनिटी की पूर्ति कर सकते हैं। अंत में, एक विशेष Ets-1 बंधने वाली साइट का म्यूटेशनल विश्लेषण कुछ न्यूक्लियोटाइड्स के बंधने के लिए सापेक्ष महत्व स्थापित करने के लिए और यह दिखाने के लिए किया गया कि Ets-1 और निकटता से संबंधित Ets-2 प्रोटीन समान अनुक्रमों के साथ बंधते हैं।