एक सामान्य पॅटर्सन-खोज विधि

पटरसन खोज या आणविक प्रतिस्थापन के लिए एक प्रक्रिया का वर्णन किया गया है जिसमें फिट के मानदंड पूरी पटरसन कार्य की विषम इकाई से मेल खाने पर आधारित होते हैं। रोटेशन खोज में, पटरसन कार्य की तुलना खोज मॉडल के स्व-पटरसन से की जाती है; अनुवाद खोज में, तुलना खोज मॉडल के पूर्ण पटरसन कार्य के साथ की जाती है। इस विधि की महत्वपूर्ण विशेषताएँ हैं: (1) पड़ोसी अणुओं के वेक्टर सेट के सभी ओवरलैप को ध्यान में रखा गया है; (2) खोज मॉडल के पड़ोसी प्रतियों के साथ सभी ओवरलैप का पता लगाया गया है और मूल्यांकन को बायपास किया गया है; और (3) फिट के मानदंड लचीले हैं और उन्हें पटरसन या प्रतिकूल स्थान में व्यक्त किया जा सकता है।