जीनोम अनुसंधान के लिए संदर्भ के रूप में दैनिक अद्यतन (क्रमबद्ध) जीवन का वृक्ष

हम एक दैनिक अद्यतन क्रमबद्ध/प्रजाति जीवन वृक्ष (sTOL) की रिपोर्ट करते हैं, जो उनके जीनोम के अनुक्रमित होने के साथ सेलुलर जीवों की बढ़ती संख्या के लिए एक संदर्भ है। sTOL एक संभाव्यता-आधारित वजन कैलिब्रेशन एल्गोरिद्म पर आधारित है जो सभी अनुक्रमित जीवों के संपूर्ण जीनोम से आणविक वर्णों के अनबायस्ड सैंपलिंग के साथ NCBI वर्गीकरण जानकारी को संकायित करता है। वर्गीकरण और आणविक डेटा के बीच सहमति की सीमा को मापने के माध्यम से, हम देखते हैं कि वर्तमान वर्गीकरण में कई संभावित सुधार किए जा सकते हैं, विशेष रूप से फंगी साम्राज्य में; हम यह भी देखते हैं कि कई पशु जीनोम की वर्तमान स्थिति काफी खराब है। sTOL के उपयोग को विकासात्मक संदर्भ प्रदान करने के लिए बढ़ाने के लिए, हम एक ऑनटोलॉजी ढांचे को एकीकृत करते हैं और परमाणु रिसेप्टर्स, स्टेम सेल और युकरियोटिक जीनोम पर विकासात्मक समझ के लिए इसके उपयोगिता का प्रदर्शन करते हैं। sTOL (http://supfam.org/SUPERFAMILY/sTOL) (क्रमबद्ध) जीवन का एक बाइनरी वृक्ष प्रदान करता है, और जीनोम विकास, कार्य और फेनोटाइप को जोड़ने वाले विश्लेषणात्मक मंच में योगदान करता है।